El convento fue fundado en el año 1590 por doña Juana de Mendoza y Zúñiga, pero no iba a ser hasta 1604 cuando la congregación ocupara definitivamente el actual edificio, un palacio renacentista de 1529 que fue donado por don Carlos de Mendoza. En el interior del edificio, el claustro, antiguo patio del palacio, con la particularidad que supone en la arquitectura renacentista complutense el conjunto de escalera y patio porticado, constituye la parte más interesante del convento.