La fundación del convento está fechada en el año 1574. La iglesia fue construida a finales del siglo XVI y es de estilo mudéjar tardío. En el interior destacan dos patios de estilo plateresco que se conservan de la antigua casa de Gutierre de Cetina, canónigo de la Magistral y fundador del convento. Tras la remodelación de una parte del mismo según proyecto de C. Clemente, acoge en la actualidad el Vicerrectorado de Extensión Universitaria.